{"id":2882,"date":"2026-09-28T20:24:31","date_gmt":"2026-09-28T18:24:31","guid":{"rendered":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/zawody\/bioinformatyk\/"},"modified":"2026-09-28T20:24:31","modified_gmt":"2026-09-28T18:24:31","slug":"bioinformatyk","status":"publish","type":"zawod","link":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/zawody\/bioinformatyk\/","title":{"rendered":"Bioinformatyk: umiej\u0119tno\u015bci, narz\u0119dzia, wynagrodzenie, kariera"},"content":{"rendered":"<p>Bioinformatyk <strong><\/strong> przekszta\u0142ca surowe dane biologiczne, g\u0142\u00f3wnie wyniki sekwencjonowania DNA i RNA, w informacje przydatne dla lekarzy, naukowc\u00f3w czy tw\u00f3rc\u00f3w lek\u00f3w. Bioinformatycy pracuj\u0105 w laboratoriach diagnostyki genetycznej, instytutach badawczych oraz firmach tworz\u0105cych oprogramowanie do odkrywania lek\u00f3w. Praca ta wymaga zar\u00f3wno umiej\u0119tno\u015bci programowania (Python, R, Linux), jak i solidnej wiedzy z zakresu biologii molekularnej.<\/p>\n<h2>Czym w praktyce zajmuje si\u0119 bioinformatyk?<\/h2>\n<p>Wi\u0119kszo\u015b\u0107 zada\u0144 bioinformatyk\u00f3w dotyczy sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Sekwenator w laboratorium genetycznym generuje miliony kr\u00f3tkich odczyt\u00f3w w plikach FASTQ. Bioinformatyk tworzy i uruchamia proces, kt\u00f3ry dopasowuje te odczyty do genomu referencyjnego, generuj\u0105c pliki BAM lub CRAM, identyfikuje warianty w plikach VCF, opatruje je adnotacjami i filtruje je do kr\u00f3tkiej listy, kt\u00f3r\u0105 mo\u017ce zinterpretowa\u0107 genetyk kliniczny. Gdy laboratorium sekwencjonuje tysi\u0105ce ca\u0142ych genom\u00f3w, praca ta staje si\u0119 w r\u00f3wnym stopniu in\u017cynieri\u0105 na du\u017c\u0105 skal\u0119, co biologi\u0105.<\/p>\n<p>Typowe zadania wymieniane w polskich og\u0142oszeniach o prac\u0119:<\/p>\n<ul>\n<li>analiza danych z sekwencjonowania ca\u0142ego genomu (WGS), ca\u0142ego eksomu (WES) oraz paneli gen\u00f3w, od surowych odczyt\u00f3w po interpretacj\u0119 biologiczn\u0105,<\/li>\n<li>analiza danych transkryptomicznych (RNA-seq, pojedyncze kom\u00f3rki) oraz danych metagenomicznych, na przyk\u0142ad genom\u00f3w bakterii lub bakteriofag\u00f3w,<\/li>\n<li>opracowywanie i utrzymywanie potok\u00f3w analitycznych oraz infrastruktury, na kt\u00f3rej dzia\u0142aj\u0105,<\/li>\n<li>tworzenie pakiet\u00f3w i narz\u0119dzi w j\u0119zyku R, czasami zgodnie z wytycznymi Bioconductor,<\/li>\n<li>przygotowywanie raport\u00f3w dla zespo\u0142\u00f3w wewn\u0119trznych i klient\u00f3w zewn\u0119trznych,<\/li>\n<li>pomoc biologom laboratoryjnym w planowaniu eksperyment\u00f3w tak, aby uzyskane dane faktycznie odpowiada\u0142y na ich pytania.<\/li>\n<\/ul>\n<p>W polskiej klasyfikacji zawod\u00f3w zaw\u00f3d ten ma sw\u00f3j w\u0142asny kod: <strong>213109 Bioinformatyk<\/strong>, w grupie biolog\u00f3w i zawod\u00f3w pokrewnych. To umiejscowienie jest wymowne. Formalnie jeste\u015b naukowcem zajmuj\u0105cym si\u0119 naukami przyrodniczymi, ale w codziennej pracy przypominasz in\u017cyniera danych, kt\u00f3ry akurat wie, czym jest miejsce splicingu.<\/p>\n<h2>Gdzie pracuj\u0105 bioinformatycy?<\/h2>\n<p>Pracodawcy dziel\u0105 si\u0119 na kilka wyra\u017anych grup, a ka\u017cda z nich inaczej kszta\u0142tuje charakter tej pracy:<\/p>\n<ul>\n<li><strong>Kliniczne i komercyjne laboratoria genetyczne.<\/strong> Firmy takie jak MNM Diagnostics w Poznaniu oraz szpitalne oddzia\u0142y genetyczne, np. w Instytucie Matki i Dziecka w Warszawie, kt\u00f3ry posiada w\u0142asne sekwenatory NovaSeq i NextSeq, analizuj\u0105 pr\u00f3bki od pacjent\u00f3w. Tutaj na pierwszym miejscu s\u0105 dok\u0142adno\u015b\u0107 i powtarzalno\u015b\u0107, poniewa\u017c wyniki maj\u0105 wp\u0142yw na diagnozy rzadkich chor\u00f3b i nowotwor\u00f3w.<\/li>\n<li><strong>Instytuty badawcze i uczelnie wy\u017csze.<\/strong> Narodowy Instytut Onkologii, instytuty PAN oraz wydzia\u0142y uniwersyteckie zatrudniaj\u0105 bioinformatyk\u00f3w do realizacji projekt\u00f3w grantowych, cz\u0119sto w po\u0142\u0105czeniu z prac\u0105 doktorsk\u0105.<\/li>\n<li><strong>Publiczna sie\u0107 badawcza.<\/strong> Sie\u0107 Badawcza \u0141ukasiewicz, na przyk\u0142ad \u0141ukasiewicz-PORT we Wroc\u0142awiu, prowadzi laboratoria diagnostyki genetycznej i mikrobiologicznej, kt\u00f3re potrzebuj\u0105 os\u00f3b do\u015bwiadczonych w pracy z klastrami HPC.<\/li>\n<li><strong>Firmy zajmuj\u0105ce si\u0119 oprogramowaniem i wykorzystaniem sztucznej inteligencji w odkrywaniu lek\u00f3w.<\/strong> Firmy takie jak Ardigen z Krakowa tworz\u0105 analityczne procesy robocze dla mi\u0119dzynarodowych klient\u00f3w z bran\u017cy farmaceutycznej. Stanowiska te najbardziej przypominaj\u0105 prac\u0119 w IT: potoki Nextflow, chmura, weryfikacja kodu, j\u0119zyk angielski jako j\u0119zyk roboczy.<\/li>\n<li><strong>Start-upy biotechnologiczne.<\/strong> Mniejsze firmy, na przyk\u0142ad te zajmuj\u0105ce si\u0119 bakteriofagami, potrzebuj\u0105 jednego lub dw\u00f3ch bioinformatyk\u00f3w, kt\u00f3rzy zajmuj\u0105 si\u0119 wszystkim \u2013 od metagenomiki po statystyk\u0119.<\/li>\n<\/ul>\n<h2>Jakich narz\u0119dzi i j\u0119zyk\u00f3w programowania oczekuj\u0105 pracodawcy?<\/h2>\n<p>Wymagania w polskich og\u0142oszeniach o prac\u0119 w dziedzinie bioinformatyki s\u0105 niezwykle precyzyjne. W og\u0142oszeniu o stanowisku kierowniczym w pozna\u0144skiej firmie diagnostycznej wymagano co najmniej pi\u0119ciu lat do\u015bwiadczenia w pracy z danymi NGS na du\u017c\u0105 skal\u0119, znajomo\u015bci j\u0119zyk\u00f3w Python lub R, bash, Docker, Git i pandas, a tak\u017ce bieg\u0142ej znajomo\u015bci systemu Linux. Wroc\u0142awskie laboratorium badawcze wymieni\u0142o konkretne formaty plik\u00f3w i narz\u0119dzia: FASTQ, BAM\/CRAM, VCF, GFF, BED, BWA, Bowtie2, GATK, samtools, bcftools oraz Nextflow lub Snakemake.<\/p>\n<p>Podstawowe narz\u0119dzia, kt\u00f3re warto zna\u0107:<\/p>\n<ul>\n<li><strong>J\u0119zyki programowania:<\/strong> Python (pandas, Biopython), R (tidyverse, Bioconductor), skrypty bash.<\/li>\n<li><strong>\u015arodowisko:<\/strong> Linux, klastry obliczeniowe i harmonogramy zada\u0144 HPC, kontenery (Docker, Singularity\/Apptainer).<\/li>\n<li><strong>Mened\u017cery przep\u0142yw\u00f3w pracy:<\/strong> Nextflow (cz\u0119sto z potokami nf-core), Snakemake, czasami WDL.<\/li>\n<li><strong>Narz\u0119dzia genomiczne:<\/strong> programy do wyr\u00f3wnywania sekwencji (BWA, Bowtie2), identyfikacja wariant\u00f3w (GATK), narz\u0119dzia do obs\u0142ugi plik\u00f3w (samtools, bcftools), bazy danych adnotacji.<\/li>\n<li><strong>Infrastruktura danych:<\/strong> Git, bazy danych SQL i NoSQL, coraz cz\u0119\u015bciej AWS lub GCP.<\/li>\n<li><strong>Raportowanie:<\/strong> Notatniki Jupyter, R Markdown lub Quarto, czasami pulpity nawigacyjne Shiny.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Biologia nie jest opcjonalna dla bioinformatyka. Pracodawcy poszukuj\u0105 os\u00f3b, kt\u00f3re rozumiej\u0105 biologi\u0119 molekularn\u0105 na tyle dobrze, by zauwa\u017cy\u0107, \u017ce dany wynik nie ma sensu z biologicznego punktu widzenia. Proces przetwarzania danych, kt\u00f3ry przebiega bez b\u0142\u0119d\u00f3w, nadal mo\u017ce by\u0107 b\u0142\u0119dny, a wykrycie tego jest cz\u0119\u015bci\u0105 pracy, kt\u00f3r\u0105 czysty programista uwa\u017ca za najtrudniejsz\u0105.<\/p>\n<h2>Jak zosta\u0107 bioinformatykiem: z kierunku biologii czy informatyki?<\/h2>\n<p>Istniej\u0105 trzy realistyczne \u015bcie\u017cki wej\u015bcia na rynek pracy, a polscy pracodawcy akceptuj\u0105 je wszystkie:<\/p>\n<ol>\n<li><strong>Dyplom z bioinformatyki.<\/strong> Kilka polskich uczelni prowadzi specjalistyczne kierunki, na przyk\u0142ad bioinformatyka i biologia systemowa na Uniwersytecie Warszawskim, a tak\u017ce kierunki bioinformatyczne na innych du\u017cych uczelniach i politechnikach. Jest to najprostsza \u015bcie\u017cka, poniewa\u017c od samego pocz\u0105tku przygotowuje do obu aspekt\u00f3w tej pracy.<\/li>\n<li><strong>Biologia lub biotechnologia w po\u0142\u0105czeniu z programowaniem.<\/strong> Najpopularniejsza \u015bcie\u017cka. Ko\u0144czysz studia z biotechnologii, biologii lub biologii medycznej, wybierasz temat pracy magisterskiej z zakresu informatyki i samodzielnie uczysz si\u0119 j\u0119zyk\u00f3w Python, R oraz systemu Linux. Og\u0142oszenia o prac\u0119 wyra\u017anie wskazuj\u0105, \u017ce magisterium z biotechnologii lub biologii \u201eze specjalizacj\u0105 w bioinformatyce\u201d jest akceptowane.<\/li>\n<li><strong>Informatyka i biologia.<\/strong> Programi\u015bci, kt\u00f3rzy przechodz\u0105 do tej dziedziny, wnosz\u0105 lepsze nawyki in\u017cynierskie, ale musz\u0105 nadrobi\u0107 zaleg\u0142o\u015bci w zakresie genetyki. W og\u0142oszeniach akceptuje si\u0119 \u201edyplom z informatyki lub pokrewnej dziedziny wraz z uko\u0144czonym szkoleniem z bioinformatyki\u201d.<\/li>\n<\/ol>\n<p>Niezale\u017cnie od wybranej \u015bcie\u017cki rekruterzy szukaj\u0105 konkretnych dowod\u00f3w: repozytorium na GitHubie z dzia\u0142aj\u0105cym procesem przetwarzania danych, wk\u0142ad w projekt open source, opublikowany artyku\u0142 zawieraj\u0105cy w\u0142asn\u0105 analiz\u0119 lub praca dyplomowa oparta na rzeczywistych danych sekwencjonowania. Publiczne zbiory danych z repozytori\u00f3w takich jak ENA czy SRA pozwalaj\u0105 \u0107wiczy\u0107 na prawdziwych danych NGS bez konieczno\u015bci dost\u0119pu do laboratorium.<\/p>\n<p>Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne (PTBI) publikuje oferty pracy i stanowisk podoktoranckich i jest dobrym miejscem do \u015bledzenia spo\u0142eczno\u015bci. W przypadku kariery naukowej tytu\u0142 doktora pozostaje silnym atutem; w przypadku stanowisk in\u017cynierskich w firmach programistycznych cz\u0119sto wi\u0119ksze znaczenie maj\u0105 wykazane umiej\u0119tno\u015bci.<\/p>\n<h2>Ile zarabia bioinformatyk?<\/h2>\n<p>Wynagrodzenia w bioinformatyce podlegaj\u0105 dw\u00f3m odr\u0119bnym rynkom. Na uczelniach i w publicznych instytutach badawczych wynagrodzenia na stanowiskach dla pocz\u0105tkuj\u0105cych cz\u0119sto s\u0105 zbli\u017cone do krajowej p\u0142acy minimalnej lub nieco j\u0105 przewy\u017cszaj\u0105, a wynagrodzenia na stanowiskach projektowych zale\u017c\u0105 od bud\u017cet\u00f3w grant\u00f3w. W prywatnych firmach diagnostycznych, a zw\u0142aszcza w firmach programistycznych obs\u0142uguj\u0105cych mi\u0119dzynarodowy przemys\u0142 farmaceutyczny, wynagrodzenia do\u015bwiadczonych specjalist\u00f3w znacznie przewy\u017cszaj\u0105 \u015bredni\u0105 krajow\u0105 i zbli\u017caj\u0105 si\u0119 do zarobk\u00f3w in\u017cynier\u00f3w danych w bran\u017cy IT.<\/p>\n<p>Co powoduje t\u0119 r\u00f3\u017cnic\u0119:<\/p>\n<ul>\n<li><strong>Forma zatrudnienia:<\/strong> firmy programistyczne cz\u0119sto oferuj\u0105 umowy B2B, kt\u00f3re zwi\u0119kszaj\u0105 kwot\u0119 faktury, ale przenosz\u0105 koszty, takie jak sk\u0142adki na ZUS i p\u0142atny urlop, na pracownika. Instytucje publiczne zatrudniaj\u0105 na podstawie umowy o prac\u0119.<\/li>\n<li><strong>Umiej\u0119tno\u015bci in\u017cynierskie:<\/strong> Nextflow, chmura, kontenery i kod na poziomie produkcyjnym zapewniaj\u0105 wy\u017csze wynagrodzenie ni\u017c sama wiedza z zakresu biologii.<\/li>\n<li><strong>Do\u015bwiadczenie kliniczne:<\/strong> brakuje os\u00f3b, kt\u00f3re pracowa\u0142y z danymi diagnostycznymi NGS zgodnie z normami jako\u015bci.<\/li>\n<li><strong>J\u0119zyk angielski i klienci mi\u0119dzynarodowi:<\/strong> stanowiska zdalne w zagranicznych firmach farmaceutycznych s\u0105 znacznie lepiej p\u0142atne ni\u017c lokalne granty badawcze.<\/li>\n<li><strong>Sta\u017c pracy:<\/strong> najwi\u0119kszy skok w wynagrodzeniu nast\u0119puje, gdy kierujesz zespo\u0142em lub odpowiadasz za proces produkcyjny.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Zanim por\u00f3wnasz ofert\u0119 B2B z umow\u0105 o prac\u0119, sprawd\u017a obie opcje za pomoc\u0105 naszego kalkulatora wynagrodze\u0144 B2B vs umowa o prac\u0119; r\u00f3\u017cnica w wynagrodzeniu netto jest cz\u0119sto mniejsza ni\u017c sugeruj\u0105 kwoty brutto.<\/p>\n<h2>Jak wygl\u0105da rekrutacja na stanowiska zwi\u0105zane z bioinformatyk\u0105?<\/h2>\n<p>Proces rekrutacji bioinformatyka zazwyczaj obejmuje po\u0142\u0105czenie rozmowy o charakterze naukowym i technicznym. Typowe etapy to rozmowa kwalifikacyjna na etapie wst\u0119pnej selekcji, rozmowa na temat Twoich projekt\u00f3w oraz zadanie praktyczne: analiza niewielkiego zbioru danych, naprawa uszkodzonego potoku przetwarzania danych lub napisanie kr\u00f3tkiego skryptu. Firmy programistyczne mog\u0105 doda\u0107 rozmow\u0119 dotycz\u0105c\u0105 programowania, podobn\u0105 do tych przeprowadzanych z programistami. Rozmowy kwalifikacyjne cz\u0119sto odbywaj\u0105 si\u0119 w j\u0119zyku angielskim, nawet w polskich firmach, poniewa\u017c zespo\u0142y i klienci maj\u0105 charakter mi\u0119dzynarodowy.<\/p>\n<p>Rekruterzy pytaj\u0105, w jaki spos\u00f3b zweryfikowa\u0142e\u015b swoje wyniki, jak poradzi\u0142by\u015b sobie z pr\u00f3bk\u0105 o niskim pokryciu lub dlaczego dwa programy do wykrywania wariant\u00f3w nie s\u0105 ze sob\u0105 zgodne. Odpowied\u017a \u201eUruchomi\u0142em GATK\u201d nie wystarczy; to w\u0142a\u015bnie wyja\u015bnienie, jakie parametry wybra\u0142e\u015b i dlaczego, wyr\u00f3\u017cnia kandydat\u00f3w. Nasz artyku\u0142 na temat przygotowania do technicznej rozmowy kwalifikacyjnej obejmuje cz\u0119\u015b\u0107 og\u00f3ln\u0105; pytania z zakresu biologii, do kt\u00f3rych musisz si\u0119 przygotowa\u0107.<\/p>\n<h2>Czy sztuczna inteligencja zast\u0105pi bioinformatyk\u00f3w?<\/h2>\n<p>Sztuczna inteligencja bardziej zmienia charakter pracy ni\u017c j\u0105 eliminuje. Asystenci programistyczni ju\u017c teraz szybciej pisz\u0105 rutynowe skrypty, a modele uczenia maszynowego przewiduj\u0105 struktury bia\u0142ek i skutki wariant\u00f3w, co wcze\u015bniej wymaga\u0142o tygodni pracy. W polskich og\u0142oszeniach o prac\u0119 coraz cz\u0119\u015bciej jako atut wymienia si\u0119 do\u015bwiadczenie w pracy z AI. Jednocze\u015bnie sekwencjonowanie staje si\u0119 coraz ta\u0144sze, wi\u0119c ilo\u015b\u0107 danych ro\u015bnie szybciej ni\u017c liczba os\u00f3b, kt\u00f3re potrafi\u0105 je odpowiedzialnie analizowa\u0107.<\/p>\n<p>Najtrudniejsz\u0105 do zautomatyzowania cz\u0119\u015bci\u0105 jest ocena: ustalenie, czy wynik jest biologicznie prawdopodobny, czy dany proces analityczny odpowiada celom klinicznym oraz jak wyja\u015bni\u0107 genetykowi istniej\u0105ce niepewno\u015bci. Bioinformatycy, kt\u00f3rzy traktuj\u0105 narz\u0119dzia sztucznej inteligencji jako \u015brodki przyspieszaj\u0105ce prac\u0119 i zachowuj\u0105 g\u0142\u0119bokie zrozumienie zagadnie\u0144 biologicznych, prawdopodobnie b\u0119d\u0105 cieszy\u0107 si\u0119 popytem jeszcze przez d\u0142ugi czas.<\/p>\n<h2>Jakie \u015bcie\u017cki kariery i powi\u0105zane stanowiska s\u0105 dla Ciebie dost\u0119pne?<\/h2>\n<p>Typowa kariera bioinformatyka przebiega od stanowiska m\u0142odszego specjalisty, przez specjalist\u0119 i starszego specjalist\u0119, a\u017c po kierownika zespo\u0142u lub architekta platformy danych. W dziedzinie bada\u0144 naukowych droga prowadzi przez doktorat i sta\u017c podoktorancki do prowadzenia w\u0142asnej grupy badawczej. Wiele os\u00f3b wybiera raczej rozw\u00f3j w poziomie ni\u017c awans pionowy:<\/p>\n<ul>\n<li><strong>In\u017cynier danych lub in\u017cynier uczenia maszynowego w naukach przyrodniczych:<\/strong> dla tych, kt\u00f3rzy bardziej ni\u017c biologi\u0119 lubi\u0105 infrastruktur\u0119 i modelowanie.<\/li>\n<li><strong>Bioinformatyka kliniczna:<\/strong> \u015bcis\u0142a wsp\u00f3\u0142praca z genetykami przy interpretacji wariant\u00f3w genetycznych.<\/li>\n<li><strong>Biologia obliczeniowa w odkrywaniu lek\u00f3w:<\/strong> biologia strukturalna, identyfikacja cel\u00f3w terapeutycznych, integracja omik.<\/li>\n<li><strong>Powr\u00f3t do pracy laboratoryjnej:<\/strong> niekt\u00f3rzy naukowcy laboratoryjni poszerzaj\u0105 swoje umiej\u0119tno\u015bci o bioinformatyk\u0119 zamiast opuszcza\u0107 laboratorium, co czyni ich bardzo cennymi pracownikami. Je\u015bli pochodzisz z tej strony, por\u00f3wnaj t\u0119 rol\u0119 z codzienn\u0105 prac\u0105 biochemika.<\/li>\n<\/ul>\n<p>W naukach o klimacie i \u015brodowisku wykorzystuje si\u0119 r\u00f3wnie\u017c podobne umiej\u0119tno\u015bci: prac\u0119 z du\u017cymi zbiorami danych, obliczenia klastrowe i statystyk\u0119. Klimatolog pracuje z plikami NetCDF zamiast plik\u00f3w BAM, ale nawyki zwi\u0105zane z odtwarzaln\u0105, zautomatyzowan\u0105 analiz\u0105 pozostaj\u0105 takie same.<\/p>\n<h2>Komu spodoba si\u0119 ta praca?<\/h2>\n<p>Bioinformatyka jest odpowiednia dla os\u00f3b, kt\u00f3re lubi\u0105 rozwi\u0105zywa\u0107 zagadki za pomoc\u0105 kodu i s\u0105 naprawd\u0119 ciekawe biologii. Wi\u0119kszo\u015b\u0107 dnia sp\u0119dza si\u0119 przy komputerze, cz\u0119sto pracuj\u0105c zdalnie lub w trybie hybrydowym, czytaj\u0105c dokumentacj\u0119, debuguj\u0105c i sprawdzaj\u0105c wyniki. Je\u015bli podoba\u0142 Ci si\u0119 zar\u00f3wno kurs genetyki, jak i Tw\u00f3j pierwszy projekt programistyczny, ta dziedzina wynagrodzi to po\u0142\u0105czenie lepiej ni\u017c prawie ka\u017cda inna.<\/p>\n<p>Mniej nadaje si\u0119 dla os\u00f3b, kt\u00f3re chc\u0105 wykonywa\u0107 praktyczn\u0105 prac\u0119 laboratoryjn\u0105, lub programist\u00f3w, kt\u00f3rzy postrzegaj\u0105 biologi\u0119 jako kolejn\u0105 dziedzin\u0119 biznesow\u0105. Dziedzina ta wymaga r\u00f3wnie\u017c ci\u0105g\u0142ego uczenia si\u0119: narz\u0119dzia i formaty plik\u00f3w ulegaj\u0105 zmianom, pojawiaj\u0105 si\u0119 nowe technologie sekwencjonowania, a to, co trzy lata temu by\u0142o najlepsz\u0105 praktyk\u0105, mo\u017ce by\u0107 ju\u017c przestarza\u0142e.<\/p>\n<h2>Cz\u0119sto zadawane pytania<\/h2>\n<h3>Czy mo\u017cna zosta\u0107 bioinformatykiem bez dyplomu z bioinformatyki?<\/h3>\n<p>Tak. Wielu polskich pracodawc\u00f3w akceptuje tytu\u0142 magistra biotechnologii, biologii lub informatyki, pod warunkiem wykazania si\u0119 praktycznymi umiej\u0119tno\u015bciami: analiz\u0105 NGS, znajomo\u015bci\u0105 j\u0119zyk\u00f3w Python lub R, systemem Linux oraz samodzielnie zbudowanym potokiem przetwarzania danych. Praca dyplomowa z zakresu oblicze\u0144, wk\u0142ad w oprogramowanie open source lub portfolio na GitHubie cz\u0119sto maj\u0105 dla rekruter\u00f3w wi\u0119ksze znaczenie ni\u017c nazwa kierunku studi\u00f3w.<\/p>\n<h3>Czy bioinformatyka to bardziej informatyka, czy biologia?<\/h3>\n<p>W codziennej pracy chodzi g\u0142\u00f3wnie o IT: pisanie kodu, uruchamianie potok\u00f3w danych, zarz\u0105dzanie danymi w klastrach. Biologia decyduje o tym, czy wyniki maj\u0105 sens i na jakie pytanie powinna odpowiedzie\u0107 analiza. Pracodawcy oczekuj\u0105, \u017ce b\u0119dziesz kompetentnym programist\u0105 rozumiej\u0105cym biologi\u0119 molekularn\u0105, a nie biologiem, kt\u00f3ry od czasu do czasu uruchamia skrypt.<\/p>\n<h3>Czy bioinformatyk mo\u017ce pracowa\u0107 zdalnie?<\/h3>\n<p>Cz\u0119sto tak. Firmy programistyczne i niekt\u00f3re przedsi\u0119biorstwa diagnostyczne oferuj\u0105 prac\u0119 ca\u0142kowicie zdaln\u0105 lub hybrydow\u0105, poniewa\u017c stanowisko to wymaga jedynie komputera i dost\u0119pu do klastra lub chmury. Laboratoria szpitalne i instytutowe cz\u0119\u015bciej oczekuj\u0105 obecno\u015bci na miejscu, przynajmniej przez cz\u0119\u015b\u0107 tygodnia, ze wzgl\u0119du na przepisy dotycz\u0105ce ochrony danych oraz \u015bcis\u0142\u0105 wsp\u00f3\u0142prac\u0119 z zespo\u0142ami laboratoryjnymi.<\/p>\n<h3>Kt\u00f3rego j\u0119zyka programowania powinienem nauczy\u0107 si\u0119 jako pierwszego?<\/h3>\n<p>Zacznij od Pythona do og\u00f3lnego tworzenia skrypt\u00f3w i przetwarzania danych, a jednocze\u015bnie naucz si\u0119 bash i Linuksa, poniewa\u017c tam dzia\u0142aj\u0105 wszystkie potoki danych. Dodaj R, je\u015bli planujesz pracowa\u0107 ze statystyk\u0105, transkryptomik\u0105 lub pakietami Bioconductor. Nast\u0119pnie naucz si\u0119 obs\u0142ugi jednego mened\u017cera przep\u0142ywu pracy, Nextflow lub Snakemake, poniewa\u017c polskie og\u0142oszenia o prac\u0119 coraz cz\u0119\u015bciej je wymieniaj\u0105.<\/p>\n<h3>Czy bioinformatycy musz\u0105 mie\u0107 stopie\u0144 doktora?<\/h3>\n<p>W przypadku kariery akademickiej i stanowisk naukowych zazwyczaj oczekuje si\u0119 stopnia doktora. W przypadku stanowisk in\u017cynierskich w laboratoriach diagnostycznych i firmach programistycznych cz\u0119sto wystarcza tytu\u0142 magistra oraz solidne do\u015bwiadczenie praktyczne. Wiele instytucji publicznych zatrudnia nawet kandydat\u00f3w, kt\u00f3rzy chc\u0105 uzyska\u0107 stopie\u0144 doktora w trakcie pracy nad projektem.<\/p>\n<p><script type=\"application\/ld+json\">\n{\n\u201e@context\u201d: \u201ehttps:\/\/schema.org\u201d,\n\u201e@type\u201d: \u201eOccupation\u201d,\n\u201ename\u201d: \u201eBioinformatyk\u201d,\n\u201edescription\u201d: \u201eSpecjalista zajmuj\u0105cy si\u0119 analiz\u0105 danych biologicznych, g\u0142\u00f3wnie wynik\u00f3w sekwencjonowania DNA i RNA, poprzez tworzenie i uruchamianie proces\u00f3w obliczeniowych na potrzeby diagnostyki, bada\u0144 naukowych i odkrywania lek\u00f3w.\u201d,\n\u201eoccupationLocation\u201d: {\n\u201e@type\u201d: \u201eCountry\u201d,\n\u201ename\u201d: \u201ePolska\u201d\n},\n\u201eskills\u201d: \u201ePython i R, Linux i bash, Nextflow lub Snakemake, Docker i Singularity, narz\u0119dzia NGS: BWA, Bowtie2, GATK, samtools, bcftools, Git i SQL, biologia molekularna i genetyka, angielski techniczny\u201d,\n\u201eresponsibilities\u201d: \u201eanaliza danych WGS, WES, panelowych, RNA-seq i metagenomicznych; opracowywanie i utrzymywanie potok\u00f3w analitycznych; adnotowanie i filtrowanie wariant\u00f3w genetycznych; przeprowadzanie analiz na klastrach HPC oraz w chmurze; przygotowywanie raport\u00f3w dla naukowc\u00f3w, klinicyst\u00f3w i klient\u00f3w\u201d,\n\u201eeducationRequirements\u201d: \"Tytu\u0142 magistra z bioinformatyki, biotechnologii, biologii lub informatyki z przeszkoleniem w zakresie bioinformatyki; w przypadku stanowisk badawczych cz\u0119sto wymagany jest stopie\u0144 doktora\u201d,\n\u201eexperienceRequirements\u201d: \u201ePraktyczne do\u015bwiadczenie w analizie danych NGS oraz programowaniu w j\u0119zyku Python lub R; stanowiska wy\u017cszego szczebla wymagaj\u0105 kilkuletniego do\u015bwiadczenia w pracy z danymi genomowymi na du\u017c\u0105 skal\u0119\u201d,\n\u201eoccupationalCategory\u201d: \u201eKZiS 213109 Bioinformatyk\u201d\n}\n<\/script><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Jak pracuje bioinformatyk: analiza danych NGS, narz\u0119dzia wymagane przez pracodawc\u00f3w, \u015bcie\u017cki kariery z biologii lub informatyki, rekrutacja i czynniki wp\u0142ywaj\u0105ce na wynagrodzenie.<\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":3447,"template":"","meta":[],"branza_zawodu":[],"class_list":["post-2882","zawod","type-zawod","status-publish","has-post-thumbnail","hentry"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/zawod\/2882","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/zawod"}],"about":[{"href":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/types\/zawod"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media\/3447"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2882"}],"wp:term":[{"taxonomy":"branza_zawodu","embeddable":true,"href":"https:\/\/epraceo.pl\/blog\/wp-json\/wp\/v2\/branza_zawodu?post=2882"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}